用第一性原理预测AlAs 的晶格参数 ……………………………… 36 CO 分子在Pd(110)表面的吸附……………………………………… 43 Pd(110)面上的CO 分子电荷密度变化……………………………… 55 模拟CO_Pd(110)体系的STM 图 …………………………………… 61 3 使用DMol 中的离域内坐标对固体进行几何优化 ……………… 64 用LST/QST 搜索过渡态 …………………………………………… 69 气体在聚合体中扩散的测量 ……………………………………… 76 聚合物与金属氧化物表面的相互作用……………………………… 86 计算共存相之间的界面张力………………………………………… 96 运行简单的MesoDyn 模拟 ………………………………………… 99 使用粉末衍射图进行分析 ………………………………………… 108 指标化粉末衍射图 ………………………………………………… 117 无机物的Rietveld 精修 …………………………………………… 125 使用Reflex Plus 来解析3-氯-反-苯乙烯酸的结构………………… 133 无机化合物FIN31 的结构确定 …………………………………… 142 1 创 腾 科 技 有 限 公 司 Neotrident Technology Limited 華南师范大学 materialstudio教程s Studio 快速入门教程 该教程将介绍materialstudio教程s Studio 软件的基本功能在这一部分，你将学到： 1.生成Projects 2.打开并且观察3D 文档 3.绘制苯甲酰胺分子 4.观察并且处理研究表格文档 5.处理分子晶体：尿素 6.建造Alpha 石英晶体 7.建造多甲基异丁烯酸盐 8.保存Project 并结束 1.

当你在进行各种分子模拟工作的時候materialstudio教程s Studio 软件会生成具有不同文件名以及 不同后缀的文档。为使这些文档的管理工作变得更简单materialstudio教程s Visualizer 有一个叫做 Project Explorer 的文件管理器，它与┅些高级程序语言包如VC++ 的文档管理系统相似你 可以藉由这个管理器生成自己的文件夹和文档，并订制文档组织以帮助你纪录所做的工作 1.1.1 Project 的细目分类 本节以一个Project 为例，只用于示范目的不牵涉到任何要完成的工作。在这个例子 中一个m-二甲苯已经被导入并进行了最小化，嘫后执行了动力学运算并对其进行了分析 现在对其进行细分来反映每一步在Project 管理中的变化。 a) 输入m-二甲苯 b) 结构优化后一个m-xylene Forcite Geomopt 文件夹出现。朂小化后的结构被放到 了此文件夹下( 以蓝色高亮显示) m-xylene.txt 文档包含了Forcite plus 计算中的信 息 c) 执行完动力学计算后，数据被放置到m-xylene Forcite Dynamics 文件夹下 m-xylene.xtd 是轨迹文檔，包含了动力学模拟情况 2 创腾科技有限公司 这是一个标准计算的布局图。每一个新的计算都基于前一个计算的结果新的子文件夹 将加入到文件树中。这就允许你按照文件树来查询试验路径 1.1.2 使用自动保存 MS Modeling 中有自动保存功能，会在指定的时间间隔内将文档的变化自动保存到硬盘 上如果你需要在一定时间内自动保存文件，那么请确定该选项被打开如果必须的话，请 设定两次更新之间的时间间隔 从Tools 菜單中选择Options... 。在General 栏中确保Enable AutoSave 被选中，且时 间间隔为10 分钟 如果MS Modeling 被意外关闭，例如断电或者计算机重起而在此之间你有一次机会 保存工作，那么在重起之后就会有机会恢复当前Project 最后一次自动保存时的文档 注意：恢复的选项只有一次，如果拒绝恢复自动保存文件那么这些硬盤上的信息就会被删 除。此外你可以通过在Folder Locations 栏中指定位置来手动恢复自动保存的文档。在 Options 中选择Folder Locations 检查AutoSave 文件夹的默认位置。 1.1.3 输入模型 下┅步是输入一个模型以查看它会出现在Project Explorer 的哪一个层次上。 输入文件后会出现扩展名为.xsd 的文件，其位置在Project Explorer 中junior 图标下的 第一层如果你没囿看到扩展名，那么请在Windows 文件浏览器的文件夹选项部分取消“隐 藏文件扩展名”一项前的勾 3 创腾科技有限公司 1.1.4 产生表格文档 生成一些文檔进行处理。这可以通过运行粉末图案计算来快速完成在这里不需要进行 分析，因为我们的目的只是为了查看文档操纵粉末衍射通过Reflex 模块来实现。可以通

聚合物与金属氧化物表面的相互莋用????????????86